4 października 2006r. odbyła się Ogólnopolska Pielgrzymka Rodziny Szkół im. Jana Pawła II na Jasną Górę, w której nasza szkoła uczestniczyła po raz pierwszy. W Częstochowie było nas 51 osób: przedstawiciele Dyrekcji, nauczyciele, uczniowie. Obecnie w całej Polsce jest ok. 580 szkół noszących imię Jana Pawła II, w których kształci się blisko 200 tys. dzieci i młodzieży.
Do Sanktuarium przybyli przedstawiciele ponad 300. szkół noszących imię Papieża z Polski - przybyli w liczbie ponad 14 tys. osób. Obecny był także wiceminister edukacji narodowej Mirosław Orzechowski. Dyrektorzy, nauczyciele i uczniowie modlili się o beatyfikację Jana Pawła II.
Mszy św. dla uczestników pielgrzymki przewodniczył ks. bp Zygmunt Zimowski, ordynariusz radomski, duszpasterz Rodziny Szkół im. Jana Pawła II. W homilii biskup odniósł się do przeżywanego Tygodnia Miłosierdzia oraz do zbliżającego się Dnia Papieskiego, który będzie obchodzony pod hasłem „Jan Paweł II Sługa Miłosierdzia".
Rodzina Szkół im. Jana Pawła II wystosowała telegram do papieża Benedykta XVI, w którym zapewniła Go o codziennej modlitwie, a także zobowiązała się do wprowadzania w codzienność nauki Patrona: „Pragniemy, aby czynienie dobra bliźnim było naszym świadectwem, że Bóg jest Miłością. Między innymi w ten sposób dzielimy się skarbem wiary z innymi. W naszych modlitwach zawierzamy Bożej Opatrzności Waszą Świątobliwość, prosząc o łaski potrzebne do wypełniania posługi Piotrowej".
Mszę św. zakończył Akt Zawierzenia Matce Bożej Rodziny Szkół im. Jana Pawła II.
W programie pielgrzymki znalazł się także koncert Magdy Anioł oraz spotkanie dyrektorów i wychowawców szkół z przedstawicielami Fundacji Dzieło Nowego Tysiąclecia.